А на персонажей предыдущего фильма просто забьют в итоге? Или как в Индиане убьют за кадром?

Не, как я понял, изначально, Дисней готовился снимать уже полностью прописанный и раскадрованный Козинским сюжет Трон:Возрождение, а линия Ареса ТАМ была второстепенная. Он - житель другой системы/эл. мира, который втайне создал Диллинджер. Лето,позвали на роль Ареса. Ему такой баланс, разумеется, не понравился, и он заявил, в 2013/14 - сделаете меня главным персом - приходите.

После грандиозного провала Земли завтрашнего дня и покупки ЛукасФилм и Марвел, Дисней заморозил проект Козински, а Лето начал раскручивать другой сюжет, в котором он - главная звезда, без всяких там Сэмов и Квор. И ему было тяжело, ибо Дисней, официально считал франшизу нерентабельной - капала с парков по миру копеечка и ладно.

Лето же вложил десятки лямов долларов в продвижение своего проекта/спиноффа "Арес", множество раз переписывал сценарий (не он, а нанятые, им, конечно, сценаристы), и в 2019 году таки убедил Дисней дать зеленый свет.
Но Козинский уже были занят Топ Ганом 2 и пр. Кроме того, видимо, ему было не очень интересно заниматься проектом с совершенно другим главным героем.
Тем не менее, режиссер Ареса позвал в продюсеры и Джозефа и Стивена Лисбергера, и, так как им обоим было не плевать на вселенную Трона, они, возможно пусть и на ролях свадебных генералов, а может и чуть более, присоединились к Аресу.

Так или иначе, для Лето это, с одной стороны, проект для себя любимого, с другой - вселенную Трона он тоже очень любит.
В итоге, мы получили возвращение Трона через Лето/Ареса, с присмотром прежних режиссеров. И вернули Флинна/Бриджесса.

Про Сэма/Хедлунда ходят слухи, что возможно его камео, но Дисней и сам Гаррет молчат об этом как рыба об лёд, но, должны ж быть у Диснея хоть какие-то сюрпризы и маркетинговые козыри в рукове.

Что точно известно, так это то, что Оливия Уайлд/Кворра была очень очень недовольна проектом Арес, и, шансы, что мы ее увидим в этом проекте, практически равны нулю. С другой стороны, если будет успех с выходящим спин-оффом, может она и подумает вернутся уже в Т4, если ее роль, опять-таки, пропишут достойно. Пока она высказывается крайне отрицательно о своём возвращению во франшизу, после заморозки проекта Трон: Возрождение.